15 Références, annexes et navigation

15.1 Introduction

Cette partie regroupe les ressources de révision : glossaire détaillé (Appendix A), aide-mémoires (Appendix B), guide d’erreurs, références officielles et pistes de publication.

15.2 Guide des erreurs fréquentes

Message / symptôme	Cause fréquente	Solution
`object 'x' not found`	Objet non créé / typo	`ls()`, revérifier le chunk
`could not find function`	Package non chargé	`library(...)`
`Cannot open file`	Mauvais chemin	`getwd()`, projet RStudio
`unexpected ')'`	Parenthese en trop/manquant	Repérer la ligne du `+` console
PDF Quarto échoue	Pas de LaTeX	`tinytex::install_tinytex()`
Jointure explosée	Clés dupliquées	`count(id)` avant join
Graphique vide	Données filtrées à 0 lignes	`nrow()` avant ggplot
Facteur → nombres bizarres	Conversion directe	`as.numeric(as.character(f))`

15.3 Tableau des fonctions R essentielles

Fonction	Rôle
`c()`	Créer un vecteur
`data.frame()` / `tibble()`	Tableau
`mean`, `median`, `sd`, `summary`	Descriptifs
`read_csv` / `write_csv`	Import / export CSV
`filter`, `select`, `mutate`	Transformation
`group_by`, `summarise`	Agrégation
`left_join`	Jointure
`ggplot` + `geom_*`	Visualisation
`lm`, `t.test`, `cor.test`	Modèles / tests
`set.seed`	Reproductibilité

15.4 Publication GitHub Pages (facultatif)

Créer un dépôt Git et pousser les sources
Rendre le livre : quarto render --to html
Publier le contenu de outputs/book/ (Actions ou branche gh-pages)
Documenter l’URL dans le README

Le livre reste consultable localement sans compte externe : ouvrez outputs/book/index.html.

15.5 Mise à jour du projet

# Régénérer les données synthétiques
Rscript R/generer_donnees.R

# Vérifier / installer les packages
Rscript R/packages_requis.R

# Rebuild
quarto render --to html

15.6 Index de navigation

Thème	Section
Installation	Section 3.7
Fondamentaux R	Chapter 4
Import	Chapter 5
Nettoyage	Chapter 6
Descriptives	Chapter 7
Graphiques	Chapter 8
Modélisation	Chapter 9
Quarto	Chapter 10
Shiny	Chapter 11
Projets	Chapter 12
Glossaire	Appendix A
Aide-mémoire	Appendix B

15.7 Références officielles

R : https://www.r-project.org/ (R Core Team 2024)
Quarto : https://quarto.org/ (Posit PBC 2024)
tidyverse : https://www.tidyverse.org/ (Wickham et al. 2019)
ggplot2 : https://ggplot2.tidyverse.org/ (Wickham 2016)
Shiny : https://shiny.posit.co/ (Chang et al. 2024)
R for Data Science : https://r4ds.hadley.nz/ (Wickham, Çetinkaya-Rundel, and Grolemund 2023)

La bibliographie formatée figure en fin d’ouvrage (chapitre Références).

# Références, annexes et navigation {#sec-annexes} ## Introduction Cette partie regroupe les ressources de révision : glossaire détaillé (@sec-glossaire), aide-mémoires (@sec-aide-memoire), guide d'erreurs, références officielles et pistes de publication. ## Guide des erreurs fréquentes | Message / symptôme | Cause fréquente | Solution | |--------------------|-----------------|----------| | `object 'x' not found` | Objet non créé / typo | `ls()`, revérifier le chunk | | `could not find function` | Package non chargé | `library(...)` | | `Cannot open file` | Mauvais chemin | `getwd()`, projet RStudio | | `unexpected ')'` | Parenthese en trop/manquant | Repérer la ligne du `+` console | | PDF Quarto échoue | Pas de LaTeX | `tinytex::install_tinytex()` | | Jointure explosée | Clés dupliquées | `count(id)` avant join | | Graphique vide | Données filtrées à 0 lignes | `nrow()` avant ggplot | | Facteur → nombres bizarres | Conversion directe | `as.numeric(as.character(f))` | ## Tableau des fonctions R essentielles | Fonction | Rôle | |----------|------| | `c()` | Créer un vecteur | | `data.frame()` / `tibble()` | Tableau | | `mean`, `median`, `sd`, `summary` | Descriptifs | | `read_csv` / `write_csv` | Import / export CSV | | `filter`, `select`, `mutate` | Transformation | | `group_by`, `summarise` | Agrégation | | `left_join` | Jointure | | `ggplot` + `geom_*` | Visualisation | | `lm`, `t.test`, `cor.test` | Modèles / tests | | `set.seed` | Reproductibilité | ## Publication GitHub Pages (facultatif) 1. Créer un dépôt Git et pousser les **sources** 2. Rendre le livre : `quarto render --to html` 3. Publier le contenu de `outputs/book/` (Actions ou branche `gh-pages`) 4. Documenter l'URL dans le README Le livre reste consultable **localement** sans compte externe : ouvrez `outputs/book/index.html`. ## Mise à jour du projet ```bash # Régénérer les données synthétiques Rscript R/generer_donnees.R # Vérifier / installer les packages Rscript R/packages_requis.R # Rebuild quarto render --to html ``` ## Index de navigation | Thème | Section | |-------|---------| | Installation | @sec-installation | | Fondamentaux R | @sec-fondements-r | | Import | @sec-acquisition | | Nettoyage | @sec-preparation | | Descriptives | @sec-descriptives | | Graphiques | @sec-visualisation | | Modélisation | @sec-modelisation | | Quarto | @sec-rapports | | Shiny | @sec-shiny | | Projets | @sec-projets | | Glossaire | @sec-glossaire | | Aide-mémoire | @sec-aide-memoire | ## Références officielles - R : <https://www.r-project.org/> [@R-core] - Quarto : <https://quarto.org/> [@quarto] - tidyverse : <https://www.tidyverse.org/> [@tidyverse] - ggplot2 : <https://ggplot2.tidyverse.org/> [@wickham2016] - Shiny : <https://shiny.posit.co/> [@shiny] - R for Data Science : <https://r4ds.hadley.nz/> [@r4ds] La bibliographie formatée figure en fin d'ouvrage (chapitre Références).